Em 1983 os profissionais dos cinco primeiros Programas com 6 a 12 anos de existência desenvolveram iniciativas para discuti-los e discutir a Pós-Graduação através de um encontro nacional. As iniciativas foram de professores da USP e prosseguiram durante o 4o. Congresso Brasileiro de Geógrafos-AGB, em julho de 1984. Professores de vários Cursos e Universidades tiveram atuação importante na mesma direção.
Em dezembro daquele mesmo ano acontecia o I° Encontro de cinco núcleos: USP, UNESP-Rio Claro, UFRJ, UFPE e UFSE, na USP, com o aval da AGB-São Paulo no ano do seu cinqüentenário. Baseou-se este encontro em três objetivos e desenrolou-se através de três Mesas Redondas e três Sessões de Debates das quais resultaram muitas propostas tendo sido aprovadas nove.
O II Encontro realizou-se na UFRJ em 1986 e o III foi organizado pelo Programa da UNESP-Rio Claro, em 1987. O IV Encontro Nacional de Pós-Graduação em Geografia, realizado na UFSC, Florianópolis, entre 1 e 4 de setembro de 1993, resultou na criação da ANPEGE-Associação Nacional de Pós-Graduação e Pesquisa em Geografia, no dia 4, tendo os representantes dos Programas existentes à época, assinado a ata de criação e aprovado o primeiro estatuto da mesma, após sessões de debates. A Diretoria eleita ficou constituída por três professores da USP:

- Prof. Dr. Milton de Almeida Santos - Presidente
- Profa. Dra. Maria Adélia Aparecida de Souza - Secretária
- Profa. Dra. Amalia Inés Geraiges de Lemos - Tesoureira

Com esta gestão, foi realizado o I Encontro Internacional da ANPEGE, sobre o tema: "Lugar, Formação Sócio-Espacial, Mundo", entre 8 e 10 de setembro de 1994, na USP; e o I° Encontro Nacional da ANPEGE, entre 5 a 9 de setembro de 1995, em Aracaju, sobre "Território Brasileiro e Globalização", tendo-se constituído de Mesas redondas, Reuniões de Trabalho, Comunicações e Assembléia Deliberativa, e publicado volume de Resumos. Deste Encontro e da 1ª. Assembléia Deliberativa participaram 23 representantes dos 9 Programas associados. Nela, depois de tratados vários temas, foi eleita a nova diretoria com professores da UFRJ:

- Profa. Dra. Berta Koiffmann Becker - Presidente
- Prof. Dr. Jorge Xavier da Silva - Secretário
- Prof. Dr. Cláudio Antônio Gonçalves Egler - Tesoureiro

O II Encontro Nacional realizou-se de 7 a 10 de setembro de 1997, no Rio de Janeiro, voltado para os "Desafios e Alternativas para a Gestão do Território", com estrutura semelhante ao anterior: Mesas Redondas, Reuniões de Trabalhos, lançamento de livros e Assembléia Deliberativa, tendo sido publicado um volume de Resumos e no ano seguinte, vários trabalhos constituíram o livro "Redescobrindo o Brasil". Com representantes de 10 Programas dos 11 existentes realizou-se a 2ª. Assembléia Deliberativa na qual foram propostas as admissões de 3 membros filiados. Discutiram-se muitos temas e nela foi eleita a nova diretoria constituída por professores da UNESP - RC:

- Profa. Dra. Lúcia Helena de Oliveira Gerardi - Presidente
- Profa. Dra. Iandara Alves Mendes - Secretária
- Prof. Dr. Odeibler Santo Guidugli - Tesoureiro

O III Encontro constituiu-se inteiramente de ações dentro da 3ª Assembléia Deliberativa, tendo como local a Reitoria da UNESP, em São Paulo, de 13 a 15 de setembro de 1999. Participaram 18 Programas dos quais 12 dos 13 associados e 6 admitidos, estando um ausente naquela Assembléia, e um membro filiado. De caráter administrativo, visou entre outras situações a modificação dos estatutos da entidade.
Esta Assembléia foi um marco importante na história das avaliações pela CAPES. Foi discutida a composição do Comitê de Avaliação e da designação de representante adjunto naquele órgão coordenador e de fomento. Também foi discutido e aprovado documento elaborado por comissão contendo "Sugestões para a Comissão de Avaliação de Pós-Graduação em Geografia da CAPES". Duas chapas se candidataram para a nova diretoria tendo sido eleitos:

- Prof. Dr. Ariovaldo Umbelino de Oliveira - USP-GH - Presidente
- Prof. Dr. Eliseu Savério Spósito - UNESP/PP- Secretário
- Profa. Dra. Lylian Coltrinari - USP-GF - Tesoureira

O IV Encontro realizou-se em São Paulo entre 23 e 26 de março de 2002, com o tema "A Geografia no Século XXI", compreendendo Conferências, Mesas Redondas, Homenagens e Sessões de Comunicações Livres. A 4ª Assembléia Deliberativa constituiu-se com representantes de 20 Programas Associados, e, como convidados, mais dois entre os três novos admitidos, além de um membro filiado. Após apresentação e discussão de temas de interesse foi eleita a nova diretoria composta por professores de distintos Programas :

- Profa. Dra. Gerusa Maria Duarte - UFSC - Presidente
- Prof. Dr. Francisco de Assis Mendonça - UFPR - Secretário
- Profa. Dra. Marlene de Muno Colesanti - UFU - Tesoureira

O V Encontro foi realizado na UFSC, em setembro e fechou um ciclo de 10 anos. Centrado no tema "Gestão do território e do ambiente no Brasil: Desafios à formação e à pesquisa em Geografia no ensino superior", compreendeu Conferências, Mesas Redondas, Painéis de Debates, apresentação de quase 400 trabalhos, Homenagens, lançamento de livros, premiação da melhor Dissertação de 2002, e, dois importantes fóruns o I Fórum de Coordenadores de Pós-Graduação em Geografia e o I Fórum de Estudantes de Pós-Graduação em Geografia, além da Assembléia Deliberativa. Após apresentação e discussão de temas de interesse foi eleita a nova diretoria composta por professores de distintos Programas:

- Prof. Dr. José Borzacchiello da Silva - UFC - Presidente
- Profa. Dra. Rita de Cássia Conceição Gomes - UFRN - Secretária
- Prof. Dr. Luiz Cruz Lima - UECE - Tesoureiro

O VI Encontro foi realizado em Fortaleza em setembro de 28 a 30. O evento contou com a participação de 567 pessoas, com uma programação que colocou à disposição dos participantes 1 conferência, 8 mesas redondas, 4 mesas/debates, 54 comunicações coordenadas e 535 comunicações científicas. Durante o evento foi eleita a nova Diretoria:

-Prof. Dr. Márcio Piñon de Oliveira (UFF) - Presidente
-Profª. Drª. Maria Célia Nunes Coelho (UFRJ) – Secretária
-Profª. Drª. Áureanice de Mello Corrêa (UERJ) – Tesoureira

O VII Encontro Nacional da Anpege teve como tema “Espacialidades Contemporâneas: o Brasil, a América Latina e o Mundo”. Foi realizado na Universidade Federal Fluminense em Niterói de 24 a 27 de setembro de 2007. O evento contou com a participação de 1035 participantes, com uma programação que colocou à disposição: 3 conferências, 4 mesas redondas, espaços para grupos de trabalho, fóruns de coordenadores, sessão de pôsteres, homenagens, lançamento de livros e revistas, etc. Na ocasião teve-se a apresentação de aproximadamente 696 trabalhos. Durante a Assembléia Geral foi votada a nova proposta de estatuto e eleita a nova Diretoria:

- Prof. Dr. Francisco de Assis Mendonça (UFPR) - Presidente
- Profª. Drª. Cicilian Luiza Löwen Sahr (UEPG) - Secretária
- Profª. Drª. Marcia da Silva (UEPG/UEM) - Tesoureira

Progressivamente a ANPEGE tem buscado discutir os Programas de Pós-Graduação, suas ações, crescimento, problemas comuns, e acompanhar as avaliações das Comissões da CAPES, não interferindo, mas buscando que sejam cada vez mais transparentes, criteriosas e democráticas.